![]() |
![]() |
NUKLEOTIDIT
AMINOHAPOT
IT-ajan ihmiset tietävät, että kaikki data voidaan tallentaa tietokoneelle
bittien eli ykkösten (1) ja nollien (0) avulla. Tavallisesti käytetään 8 merkin
(bitin) pituisia koodeja (tavuja) eli ykkösistä ja nollista voidaan muodostaa 2
8
=256 erilaista yhdistelmää. Esimerkiksi isoa A-kirjainta vastaa koodi 01000001.
VALKUAISAINEET
Nukleotidien järjestykseen kätkeytyy perimän koodit, sillä se määrää
valkuaisaineiden aminohappojärjestyksen. Kun ajattelemme miten 20 erilaista
aminohappoa voidaan järjestää ketjuksi kolmen ryhmiin saamme 20
3
=8000 eri tapaa, jos aminohappoketjussa on kuusi peräkkäistä aminohappoa saamme
20
6
eli 64 miljoonaa erilaista vaihtoehtoa! Valkuaisainemolekyylissä voi olla
kuitenkin tuhansia aminohappoja peräkkäin, siten vaihtoehtoja on lähes
äärettömästi.
Kullakin eliölajilla on sille tyypilliset valkuaisaineet ja vieraan
valkuaisaineen tunkeutuminen elimistöön aiheuttaa monesti allergisen reaktion.
Luonnossa esiintyviä valkuaisaineita on valtavan paljon ja niiden tehtävät ovat
monenlaiset. Kukin molekyylirakenne sopii vain tiettyyn tehtävään.
Valkuaisaineet toimivat
ennenkaikkea
entsyymeinä
eli katalysoivat reaktioita sekä solun rakennusaineina ja vasta-aineina.
PROTEIINISYNTEESI
Toimiessaan geeni tuottaa jotain entsyymiä, joka on siis valkuaisainetta.
Entsyymit vuorostaan ohjaavat solun toimintoja. Entsyymit ovat biologisia
katalyyttejä ja kukin entsyymi voi katalysoida vain tiettyä reaktiota. Solun
tarvitessa jotain tiettyä valkuaisainetta avautuu kromosomin DNA kahdeksi
puoliskoksi emästen irrotessa pareistaan juuri tämän valkuaisaineen ohjeen kohdalta. Valkuaisainesynteesi alkaa aina emäskolmikolla
T
A
C
(metioniini)
ja päätekolmikkona voi olla
A
T
T
,
A
T
C
tai
A
C
T
.
Lähetti-RNA
kopioi ohjeen ja kuljettaa sen
tumasta
ribosomeille
, jossa se tulkitaan ja valkuaisainen rakentuu ohjeen mukaiseksi. Tuloksena on
sitten näkyvä ominaisuus, perinnöllinen käyttääytyminen tai vaikka
aineenvaihdunnallinen ominaisuus. Jos DNA:ssa on virheellinen valkuaisaineen
valmistusohje
(
geenivirhe
) voi tuloksena olla jokin sairaus.
GENEETTISTÄ SANASTOA
Yksinkertaisuuden vuoksi sanotaan yleensä tietyn ominaisuuden tai piirteen
(koiran koko, väri, rakenne, luonne) periytyvän vanhemmilta jälkeläisille.
Ominaisuudet eivät kuitenkaan sellaisinaan periydy, vaan niitä
koodaavat
DNA-jaksot eli geenit
. Tietyn pituinen DNA-jakso vastaa yhtä geeniä.
Toimiessaan geenit saavat solun
tuottamaan
proteiineja
. Oikeastaan geeni on
"resepti", jonka mukaan valmistetaan tietty proteiini. Proteiinit
ovat ryhmä monimutkaisia molekyylejä, joilla jokaisella on oma tehtävänsä kehon
rakenteessa ja toiminnassa. Esimerkiksi insuliini, jonka tehtävänä on elimistön
sokeripitoisuuden säätely on proteiini, samoin kollageeni, joka on luiden,
rustojen ja ihon rakenneosa on proteiini. Ihon ja karvojen väriä määrittävä
melaniinikin on proteiini. Joskus geenit vaikuttavat ominaisuuksiin
epäsuorasti. Geenit vaikuttavat korvan kokoon ja hännän asentoon, mutta ei ole
olemassa
erityistä "korvan koko"- tai "hännän asento"-geeniä.
Lyhyesti sanottuna geenit
"kertovat" solulle mitä proteiineja valmistetaan, miten paljon ja
milloin.
DNA koostuu pienistä
rakenneyksiköistä -
nukleotideista. Jokaisessa nukleotidissa on fosfaattiosa,
sokeriosa
(
deoksiriboosi
) ja emäsosa. Sokeri- ja fosfaattiosat ovat kaikissa nukleotideissa
samanlaiset, mutta ne eroavat toisistaan emäsosaltaan. Juuri emäsosat tekevät
nukleotideista erilaisia. Mahdollisia emäsosia on neljää tyyppiä adeniini (
A
), tymiini (
T
), guaniini (
G
) ja sytosiini (
C
). Yksinkertainen nukleotidiketju voi olla emäsjärjestykseltään melkein
minkälainen tahansa (kunhan se pystyy koodaamaan valuaisaineen valmistusta).
DNA:ssa nukleotidit ovat pareittain muodostaen kierteisen rakenteen. Fosfaatti-
ja sokeriosat muodostavat tikapuurakenteen raamit ja emäsosat sen askelmat.
Emäsosat eivät kuitenkaan voi liittyä pareittain miten sattuu. Ne ovat kuin
pikkulapsen kahden palan palapelin osat. Kirahvin pää ei sovi elefantin
takaosaan, eikä kirahville voi laittaa elefantin päätä. Emäksistä adeniini ja
tymiini muodostavat parin eli tikapuurakenteen "askelman" ja guaniini
ja sytosiini oman "askelman". Siten esimerkkimme nukleotidiketjun pariksi
sopii ainoastaan:
Liekö sattuma, että perinnöllinen koodi, vai pitäisikö sanoa "data"
on koodattu samaan tapaan. Nyt käytettävissä on kuitenkin 1 ja 0 sijaan neljä
erilaista yksikköä - emäkset adeniini (
A
), tymiini (
T
), guaniini (
G
) ja sytosiini (
C
). Geneettinen tavu eli aminohappo on kuitenkin vain kolmen merkin mittainen.
Siten emäkset voidaan ryhmitellä
kolmikoiksi
(
tripletti, kodoni
) 4x4x4=64 eri tavalla.
Nämä kolmikot vastaavat
eri
aminohappoja
. Koska triplettejä voi olla 64 erilaista, mutta luonnossa tunnettuja
aminohappoja on vain 20, voi tiettyjä aminohappoja vastata useampikin
emäskolmikko. Kutakin aminohappoa tarkoittava ohje on siis aina kolme
peräkkäistä emästä. Oheisessa taulukossa alkava emäs on vasemmanpuolimmaisessa sarakkeessa ja lopettava emäs oikealla viimeisenä, keskimmäinen emäs neljässä sarakkeessa keskellä.
A
G
T
C
A
AAA fenylalaniini
AGA seriini
ATA tyrosiini
ACA kysteiini
A
AAG fenylalaniini
AGG seriini
ATG tyrosiini
ACG kysteiini
G
AAT leusiini
AGT seriini
ATT lopetuskodoni
ACT lopetuskodoni
T
AAC leusiini
AGC seriini
ATC lopetuskodoni
ACC tryptofaani
C
G
GAA leusiini
GGA proliini
GTA histidiini
GCA arginiini
A
GAG leusiini
GGG proliini
GTG histidiini
GCG arginiini
G
GAT leusiini
GGT proliini
GTT glutamiini
GCT arginiini
T
GAC leusiini
GGC proliini
GTC glutamiini
GCC arginiini
C
T
TAA isoleusiini
TGA treoniini
TTA asparagiini
TCA seriini
A
TAG isoleusiini
TGG treoniini
TTG asparagiini
TCG seriini
G
TAT isoleusiini
TGT treoniini
TTT lysiini
TCT arginiini
T
TAC metioniini
TGC treoniini
TTC lysiini
TCCarginiini
C
C
CAA valiini
CGA alaniini
CTA asparagiinihappo
CCA glysiini
A
CAG valiini
CGG alaniini
CTG asparagiinihappo
CCG glysiini
G
CAT valiini
CGT alaniini
CTT glutamiinihappo
CCT glysiini
T
CAC valiini
CGC alaniini
CTC glutamiinihappo
CCC glysiini
C
Aminohappo
=typpipitoinen orgaaninen yhdiste, proteiinien rakenneosa. Luonnossa esiintyy
20 erilaista aminohappoa
Deoksiriboosi
=viisi hiiliatomia sisältävä sokerimolekyyli, DNA:n nukleotidien yksi
rakennusosa.
DNA
=deoksiribonukleiinihappo, eliön perinnöllistä tietoa säilyttävä, nukleotideista koostuva yhdiste. DNA sijaitsee solun tumassa.
Entsyymi
=katalyyttinen proteiini. Yhdiste, joka katalysoi solun sisäistä tai ulkoista
reaktiota. Entsyymit ovat spesifisiä eli tietty entsyymi voi katalysoida vain
tiettyä reaktiota.
Geeni
= perinnöllistä ominaisuutta ohjaava DNA-jakso, joka sisältää proteiinin
valmistusohjeen.
Geenivirhe
=DNA-ketjussa yhden tai muutaman emäsparin vaihtumisesta johtuva perinnöllisen
tiedon muutos, joka muuttaa aminohapon toiseksi, toimimattomaksi tai
vajaatoimiseksi.
Kodoni, tripletti
=kolmen nukleotidin muodostama sarja, aminohappo
Lähetti-RNA
=RNA-molekyyli, joka kuljettaa geenin perinnöllisen tiedon ribosomeille
proteiinisynteesin malliksi.
Nukleotidi
=nukleiinihapon rakenneosa, jonka osina ovat sokeri, fosforihappotähde ja
orgaaninen emäs.
Proteiini
=valkuaisaine, yhdestä tai useammasta aminohappoketjusta muodostuneita
yhdisteitä.
Ribosomi
=solulimassa olevia partikkeleja, joiden kalvoissa valkuaisainesynteesi
tapahtuu.
sivun alkuun